由中華醫(yī)學(xué)會、中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)分會主辦的中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會-2018(第十九次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議)(CTS)正在蘇州召開。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院院長瞿介明教授介紹了《病原學(xué)診斷新技術(shù)在肺部感染中的診斷價值及應(yīng)用》。
肺部感染病原學(xué)診斷現(xiàn)狀
目前,呼吸道感染在全球疾病負(fù)擔(dān)排名中躍居榜眼。肺部感染病原構(gòu)成復(fù)雜,新發(fā)未知病原流行頻現(xiàn),在重癥肺炎病例中有20%-25%病原不明,膿毒血癥病例中40%-50%病原不明。
病原學(xué)診斷方法
傳統(tǒng)的病原體檢測技術(shù)主要是基于微生物培養(yǎng)和分離,方法包括涂片鏡檢、標(biāo)本分離培養(yǎng)、生物化學(xué)試驗以及常規(guī)的血清學(xué)試驗等,當(dāng)下依舊在大多數(shù)微生物實驗室廣泛使用,在病原體的檢驗及鑒定中具有不可替代的地位。
病原檢測新技術(shù)的應(yīng)用及病例分享
基于高通量測序技術(shù)的臨床宏基因組學(xué),通過分析臨床標(biāo)本中微生物的核酸進行致病菌的檢測,不需要對病原體進行意向性預(yù)判,能夠檢出"未知"病原體及多種混合感染病原體,一站式精準(zhǔn)測序,簡化檢測流程,大大提高了病原檢測的敏感度,縮短了檢測時間。
病例:55歲男性患者,彌散大B細(xì)胞淋巴瘤患者CHOP方案化療后出現(xiàn)肺部感染,抗感染治療效果欠佳,經(jīng)過NGS明確為耶氏肺孢子菌感染,臨床用藥增大復(fù)方磺胺甲惡唑劑量,停用卡泊芬凈、更替洛韋后病情好轉(zhuǎn)。--NGS在鑒定疑難、罕見感染病原及非典型病原體等常規(guī)檢測技術(shù)鑒定難度大的病原體方面具有重要的臨床應(yīng)用價值。
傳統(tǒng)病原體檢測涵蓋臨床常見病原菌,具有一定的靶向性,陽性預(yù)測價值大。NGS無靶標(biāo)測定標(biāo)本中所有微生物,靈密度高,陰性預(yù)測價值大。兩種方法互為補充、平行送檢可有效提高檢出率。
病例:23歲男性患者,反復(fù)咳嗽咯血5個月,外院間斷抗感染加止血治療后癥狀反復(fù),NGS檢查顯示牙齦卟啉單胞菌陽性,這是否背景菌污染?最終結(jié)合臨床綜合判斷,確診為肺結(jié)核。--任何的檢測技術(shù)均應(yīng)結(jié)合流行病學(xué)、臨床特征等綜合分析,去偽存真,確定其是否為真正致病菌。
總結(jié):
1.mNGS為感染病原體檢測提供了新的方法,主要用于常規(guī)方法難檢出病原體的檢測,為肺部感染精準(zhǔn)診療提供依據(jù);
2.標(biāo)本送檢中,如常規(guī)檢測陰性時,必要時送檢NGS;
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